Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG1Q06432 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNG1Q06432 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNG1Q06432 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms