Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC18A2Q05940 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms