Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP7AQ04656 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP7AQ04656 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms