Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCNT1Q02742 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms