Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG1Q02297 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms