Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNAP25P60880 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNAP25P60880 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms