Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ERVFC1-1P60608 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ERVFC1-1P60608 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms