Protein–RNA interactions for Protein: P60153

RNASE9, Inactive ribonuclease-like protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE9P60153 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNASE9P60153 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms