Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN17P56750 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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CLDN17P56750 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLDN17P56750 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLDN17P56750 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLDN17P56750 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLDN17P56750 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLDN17P56750 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLDN17P56750 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLDN17P56750 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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