Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOSBP53539 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FOSBP53539 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOSBP53539 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOSBP53539 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms