Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFMP43652 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFMP43652 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms