Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF9P41273 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms