Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATP5C1P36542 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms