Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms