Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCD1P33897 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCD1P33897 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms