Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms