Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DUSP1P28562 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms