Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRB3P28472 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRB3P28472 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRB3P28472 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRB3P28472 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRB3P28472 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRB3P28472 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRB3P28472 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRB3P28472 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRB3P28472 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRB3P28472 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRB3P28472 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRB3P28472 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRB3P28472 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms