Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK11BP21127 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK11BP21127 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms