Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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NFKB1P19838 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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