Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms