Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms