Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMPD1P17405 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms