Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB1P16220 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms