Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms