Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLBP06746 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLBP06746 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLBP06746 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms