Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VTNP04004 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VTNP04004 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VTNP04004 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms