Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN11O75508 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN11O75508 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms