Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TULP3O75386 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TULP3O75386 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TULP3O75386 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TULP3O75386 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TULP3O75386 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms