Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COQ9O75208 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COQ9O75208 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms