Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ACSL4O60488 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSL4O60488 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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