Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF10O15013 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms