Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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