Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TISP43B9A030 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TISP43B9A030 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms