Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF839A8K0R7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF839A8K0R7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms