Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SOBPA7XYQ1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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