Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRD1A4D1F6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms