Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms