Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAI2Q9Y5P3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms