Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AC022395.1-201ENST00000451610 895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AC098617.1-207ENST00000594591 810 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX6Q9UPM6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX6Q9UPM6 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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