Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
COPS3Q9UNS2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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