Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC23Q9UJX2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms