Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2IRD1Q9UHL9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms