Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

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Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRPC4Q9UBN4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TRPC4Q9UBN4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRPC4Q9UBN4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRPC4Q9UBN4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRPC4Q9UBN4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRPC4Q9UBN4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TRPC4Q9UBN4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TRPC4Q9UBN4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TRPC4Q9UBN4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRPC4Q9UBN4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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