Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC180Q9P1Z9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms