Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms