Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDE1Q9NZC3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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