Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG3Q9NT62 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG3Q9NT62 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms