Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT82Q9NSB4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms