Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GSDMCQ9BYG8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms